2023年9月被认定校级科技创新机构包括新疆农业大学土地科学研究所（负责人：邵战林）

新疆农业大学自然资源管理创新发展研究中心（负责人：陈前利）

新疆农业大学民生高质量发展研究中心（负责人：王华丽）

新疆农业大学绿色发展法治研究中心（负责人：刘晶）

新疆农业大学碳中和与生态环境治理研究中心（负责人：王志强）